Актуальность проблемы обусловлена трансформацией высшего педагогического образования в сторону исследовательски-ориентированной модели и пересмотра концептуальных основ подготовки будущих учителей, поскольку от эффективности их научно-исследовательской работы (НИР) зависит способность творчески решать профессиональные задачи и адаптироваться к динамичной образовательной среде. Исследование направлено на определение концептуальных оснований, объединяющих эмпирически выявленные закономерности и системы принципов, на базе которых осуществляется педагогическое управление НИР. В работе применялись такие методы, как теоретический анализ научной литературы по проблеме исследования; ретроспективный анализ собственного педагогического опыта; моделирование; опрос студентов бакалавриата с целью выявления отношения к исследовательской деятельности. Определены концептуальные основания, объединяющие эмпирически выявленные закономерности, отражающие связь исследовательской среды и развития профессиональной мотивации, взаимообусловленность исследовательских умений и критического мышления, а также обусловленность эффективности НИР этапностью ее организации. На основе данных закономерностей предложена система принципов педагогического управления НИР студентов, базирующаяся на преемственности, интеграции науки и профессии, индивидуализации исследовательской траектории и практикоориентированности. Реализация принципов способствует формированию у студентов исследовательской компетентности как метапредметного результата педагогического образования, обеспечивающего их готовность к инновационной профессиональной деятельности. Теоретическая значимость исследования состоит в обосновании научно-исследовательской работы как непрерывного процесса, проходящего стадии от учебно-исследовательской деятельности к научно-исследовательской и далее к научно-прикладной. Нарушение преемственности этапов ведет к дискретности и формализму результатов. Между развитием исследовательских умений и профессиональной мотивацией существует прямая корреляционная связь. Чем выше степень осознания студентом практической значимости исследования для будущей работы в школе, тем выше качество его НИР. Следовательно, отрыв тематики исследований от реальных проблем школы разрушает мотивационную основу. Практическая значимость работы детерминирована комплексной характеристикой принципов педагогического управления НИР, которые образуют систему, где каждый принцип усиливает действие другого.