Вес самостоятельной работы студентов университетов увеличивается с каждым годом. Это связано и с увеличением доли часов, отведенных на нее, и с изменением критериев оценки учебной деятельности. Цифровизация образования вносит свои коррективы в этот процесс. Необходимо отметить важность целенаправленного управления самостоятельной работой, создания единой рабочей слаженной программы управления подобной деятельностью студентов. Исследование, результаты которого описаны в данной работе, проводилось на базе Алтайского государственного гуманитарно-педагогического университета имени В. М. Шукшина со студентами естественно-научных профилей. Его целью явилась разработка единой программы управления самостоятельной работой студентов в условиях цифровизации образования. Программа построена по модели управления, описанной в работах по менеджменту А. Файоля. В программе выделены ключевые этапы, от разработки нормативной документации по созданию единой образовательной цифровой среды университета до налаживания каналов взаимодействия всех участников учебного процесса. Создание единой цифровой среды, позволяющей эффективно взаимодействовать в рамках образовательного процесса, является актуальной задачей, особенно в последнее время. Апробация программы управления осуществлялась в течение двух лет. Начало работы над исследованием пришлось на активную фазу вынужденного дистанционного обучения, введенного повсеместно из-за эпидемиологической обстановки в стране. Таким образом, удалось выявить в полевых условиях слабые места развивающейся информационной структуры, провести необходимую корректировку. Данные, полученные в результате исследования, говорят о повышении качества вовлеченности студентов в образовательный процесс при самостоятельной работе. Это подтверждается в том числе и публикационной активностью обучающихся. Результаты двухлетних наработок и составленная программа могут быть использованы административными службами образовательных учреждений в работе, направленной на повышение качества организации самостоятельной работы студентов посредством электронных образовательных ресурсов. Кроме того, результаты проведенного исследования могут быть востребованы в учебном процессе учреждений среднего профессионального образования, школ, а также в системе повышения квалификации педагогов.